Проф. Тодор Кантарджиев е член на БСП в организацията на Корнелия Нинова в район "Оборище" в гр. София. Това потвърдиха пред ТВ"Евроком" от пресцентъра на Левицата. 

Съмнения относно принадлежността на професора към БСП възникнаха, след като лидерът на партията изпрати позиция във връзка с неочакваното му пенсиониране като директор директор на Националния център по заразни и паразитни болести (НЦЗПБ). В своя коментар Нинова посочи:

Изразявам позиция, не защото Тодор Кантарджиев е член на БСП,а защото въпросът е принципен.

Уволненията на служебното правителство не бива да са самоцелни. Хора с доказани професионални и морални качества не трябва  да се сменят. Професор Кантарджиев е почтен човек и доказан специалист в своята област.